В соответствии со статьей 83 НК РФ аптека обязана встать на учет в налоговых органах по местонахождению каждого аптечного пункта, являющегося обособленным подразделением.
Определение обособленного подразделения для целей налогообложения дано в пункте 2 статьи 11 НК РФ: обособленным подразделением организации признается любое территориально обособленное от нее подразделение, по месту нахождения которого оборудованы стационарные рабочие места.
Обособленное подразделение организации признается таковым независимо от того, отражено ли его создание в учредительных или иных организационно-распорядительных документах организации, и от полномочий, которыми оно наделяется. Рабочее место считается стационарным, если оно создается на срок более одного месяца.
В соответствии со статьей 55 ГК РФ в Уставе общества указываются только филиалы и представительства, определения которых даны в этой же статье.  Аптечные киоски в Уставе указывать не нужно.
Также аптека должна встать на учет в качестве плательщика ЕНВД в каждом муниципальном образовании, на территории которого ведется деятельность, облагаемая этим налогом (абзац 2 пункта 2 статьи 346.28 НК РФ).
С 01.01.2013 г. организации переходят на уплату единого налога добровольно (изменения в пункт 1 статьи 346.28 НК РФ введены Федеральным законом РФ от 25.06.2012 г. № 94 –ФЗ), поэтому аптека и ее структурные подразделения- аптечные киоски могут с 2013 г. перейти на упрощенный режим налогообложения или общий режим налогообложения.
Если аптека будет продолжать ......